5月11日,泰康人工智能研究院机器感知算法团队,首次参加Kaggle-HuBMAP: Hacking the Kidney 全球算法竞赛,历时3个月,从1216个竞赛队伍中脱颖而出摘得银奖。
Kaggle-HuBMAP:Hacking the Kidney是国际性AI算法竞赛,该AI算法竞赛目标以实现一个强大的肾小球FTU检测器,针对人体肾脏组织图像的肾小球进行高精度识别和分割,以单细胞分辨率绘制人类肾脏的图谱,要检测不同组织准备管道中的功能组织单位(FTU)。HUBMAP(译名:人类生物分子图谱计划)由美国国立卫生研究院(NH)赞助,是有史以来第一次对腎小球功能进行分析的项目。 HUBMAP有希望成为世界上最大的合作生物项目之一,旨在成为人体细胞水平的开放地图。共同推进人类认识细胞,更好的了解组织学及其功能,以帮助人类更好的理解健康。该数据集和相关成果可帮助研究人员、制药公司研发创新的治疗方法和医药产品。
竞赛中,团队首先对大赛提供的数据进行分析,定位比赛难点。难点主要涉及两方面: 1)肾脏组织图像的理解分辨需要专业医学知识,尤其其中肾小球具有硬化性和非硬化性2种形态,其中非硬化性形态肾小球与周围组织界限不分明,非专业医学人士很难肉眼分辨。 2)人体肾脏组织图像来源不同,对应图像分辨率、颜色、形态发生变化,增加识别难度。
6位算法专家历时3个月的努力,从数据预处理、模型构建训练和预测后处理等三方面,先后尝试了40余种数据扩增组合,通过不断的改进和迭代最终确定最优组合,增加膨胀预测、测试时增强方法和交叉验证等训练预测技巧提升精度。